土壤微生物群落是在生物和非生物因素的綜合調(diào)控作用下，一定面積或體積的土壤中的病毒、細(xì)菌、放線菌和土壤藻類(lèi)等構(gòu)成的生物群體。其區(qū)系組成、種群數(shù)量、生物活性等與土壤類(lèi)型、植被、氣候等密切相關(guān)，而人、雞、豬糞便則能為土壤微生物群落提供良好的生長(zhǎng)條件。
本研究旨在解決抗生素抗性基因（ARGs）在人類(lèi)、動(dòng)物和環(huán)境間的傳播問(wèn)題，這對(duì)于評(píng)估抗微生物抗性（AMR）對(duì)公共衛(wèi)生的威脅至關(guān)重要。抗生素抗性的不斷進(jìn)化對(duì)臨床管理和預(yù)防細(xì)菌感染提出了越來(lái)越大的挑戰(zhàn)，因此，了解抗性基因的組成和準(zhǔn)確量化ARGs的當(dāng)前豐度成為當(dāng)務(wù)之急。
本研究綜合分析中國(guó)不同省份的人類(lèi)、雞、豬糞便和土壤微生物組中細(xì)菌群落組成、ARGs和毒力因子（VFs）的分布和多樣性。核心關(guān)鍵技術(shù)包括宏基因組測(cè)序和生物信息學(xué)分析，通過(guò)與CARD數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)識(shí)別ARGs。本研究揭示了多藥耐藥性在所有樣本中的普遍性，且ARGs與特定細(xì)菌類(lèi)群存在顯著相關(guān)性，尤其是在土壤樣本中。研究解決了如何通過(guò)篩選ARGs子集作為指標(biāo)，以高精度評(píng)估樣本中的ARGs污染水平問(wèn)題，展現(xiàn)了在ARGs污染評(píng)估方法上的先進(jìn)性。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于《Science of the Total Environment》（中科院一區(qū)TOP期刊，影響因子8.2）。
該研究由國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2023YFD1300400和2022YFF1000100）、國(guó)家自然科學(xué)基金（32225046和U22A20507）等項(xiàng)目支持，顯示了國(guó)家層面對(duì)抗生素抗性研究的重視和支持。通過(guò)這些項(xiàng)目的資助，研究團(tuán)隊(duì)能夠深入分析ARGs的分布和多樣性，為公共衛(wèi)生安全和食品安全提供了科學(xué)依據(jù)，對(duì)于制定相關(guān)政策和干預(yù)措施具有重要意義。