土壤微生物群落是在生物和非生物因素的綜合調控作用下,，一定面積或體積的土壤中的病毒、細菌,、放線菌和土壤藻類等構成的生物群體,。其區(qū)系組成、種群數(shù)量,、生物活性等與土壤類型,、植被、氣候等密切相關,，而人,、雞、豬糞便則能為土壤微生物群落提供良好的生長條件,。
本研究旨在解決抗生素抗性基因（ARGs）在人類,、動物和環(huán)境間的傳播問題，這對于評估抗微生物抗性（AMR）對公共衛(wèi)生的威脅至關重要,?？股乜剐缘牟粩噙M化對臨床管理和預防細菌感染提出了越來越大的挑戰(zhàn)，因此,，了解抗性基因的組成和準確量化ARGs的當前豐度成為當務之急,。
本研究綜合分析中國不同省份的人類、雞,、豬糞便和土壤微生物組中細菌群落組成,、ARGs和毒力因子（VFs）的分布和多樣性。核心關鍵技術包括宏基因組測序和生物信息學分析,，通過與CARD數(shù)據(jù)庫比對識別ARGs,。本研究揭示了多藥耐藥性在所有樣本中的普遍性，且ARGs與特定細菌類群存在顯著相關性,，尤其是在土壤樣本中,。研究解決了如何通過篩選ARGs子集作為指標，以高精度評估樣本中的ARGs污染水平問題,，展現(xiàn)了在ARGs污染評估方法上的先進性,。相關研究結果發(fā)表于《Science of the Total Environment》（中科院一區(qū)TOP期刊，影響因子8.2）,。
該研究由國家重點研發(fā)計劃（2023YFD1300400和2022YFF1000100）,、國家自然科學基金（32225046和U22A20507）等項目支持,，顯示了國家層面對抗生素抗性研究的重視和支持。通過這些項目的資助,，研究團隊能夠深入分析ARGs的分布和多樣性,，為公共衛(wèi)生安全和食品安全提供了科學依據(jù)，對于制定相關政策和干預措施具有重要意義,。