【摘要】研究發(fā)現(xiàn)，HFD顯著影響鵝肝臟組織的染色質區(qū)室重組,，改變了約23.80Mb的染色質區(qū)域（2.42%）,。
為研究鵝肝臟組織脂肪變性耐受和易感等特性，我院家禽遺傳育種團隊與四川農業(yè)大學李明洲教授課題組合作,，以飼喂HFD18天的成年天府肉鵝肝臟組織和飼喂HFD 112天的成年昆明小鼠的肝臟組織為研究對象,，通過生理生化指標檢測及多組學（Hi-C、ChIP-Seq和RNA-seq）數(shù)據(jù)分析,，篩選鵝的三維基因組結構特異性調控脂質代謝和肝臟疾病相關基因（圖1）。
研究發(fā)現(xiàn),，HFD顯著影響鵝肝臟組織的染色質區(qū)室重組,，改變了約23.80Mb的染色質區(qū)域（2.42%）。染色質區(qū)室Compartment A轉變B涉及148個基因主要與能量代謝相關,；相反,，當Compartment B轉A時的123個基因主要參與代謝過程和免疫反應。在啟動子-增強子互作分析中,，HFD組與能量代謝和細胞分化相關的基因RPS值顯著增高,，而與疾病相關的基因RPS值顯著降低?？缥锓N研究發(fā)現(xiàn),，鵝和小鼠在脂類代謝、免疫通路及肝?。∟AFLD和HCC）相關基因的三維結構調控存在差異,。
本研究首次利用Hi-C技術構建鵝肝臟組織染色質互作圖譜，揭示其三維基因組結構對脂質耐受性與易感性的影響,，處于該領域的研究前沿,。該研究獲得國家重點研發(fā)計劃（2022YFF1000100和2023YFD1300012）和國家自然科學基金（32225046）等項目資助，研究結果已發(fā)表在Journal of Animal Science and Biotechnology （中科院一區(qū)Top期刊,，中國卓越計劃領軍期刊,，IF=6.3）。
